Resumen de Cytoscape

Cytoscape es una plataforma de software de código abierto destinada a la visualización de redes de interacción molecular y vías biológicas, así como a la integración de dichas redes con anotaciones, perfiles de expresión génica y otros datos de estado. Aunque Cytoscape se diseñó originalmente para la investigación biológica, actualmente es una plataforma general para el análisis y la visualización de redes complejas. La distribución principal de Cytoscape ofrece un conjunto básico de funciones para la integración, el análisis y la visualización de datos. Hay funciones adicionales disponibles en forma de aplicaciones (antes denominadas «plugins»). Hay aplicaciones disponibles para el análisis de redes y perfiles moleculares, nuevos diseños, compatibilidad con formatos de archivo adicionales, scripting y conexión con bases de datos. Cualquier persona puede desarrollarlas utilizando la API abierta de Cytoscape, basada en tecnología Java, y se fomenta el desarrollo de aplicaciones por parte de la comunidad. La mayoría de las aplicaciones están disponibles de forma gratuita en la Tienda de aplicaciones de Cytoscape.

Nota: Aunque el software está clasificado como gratuito, en realidad se trata de un «donationware». Por favor, considera la posibilidad de hacer una donación para ayudar a financiar su desarrollo.

Novedades de la versión 3.10.4

Se corrigió un error donde abrir una red en Cytoscape desde Cytoscape Web configuraba incorrectamente el nombre de la colección a ?(SUID: ##)
Se corrigió un error donde los estilos se corrompían si Se Abrían Tareas en cualquier momento antes de invocar cerrar sesión
Se corrigió un error donde mover un grupo de nodos falla después de recargar en Cytoscape
El control “Diseñar solo nodos seleccionados” en el cuadro de diálogo de Configuración de Diseño ahora es un botón etiquetado Aplicar a Nodos Seleccionados, haciendo la acción más explícita y fácil de usar